在國家解體之際逃往日本政治避難，獨裁國家統(tǒng)治者西亞古共和國將軍卡路瑪，在此期間他發(fā)表了制造恐怖活動的聲明。多年過去，卡路瑪麾下一群身上文有“梵”字的特工接連自殺，而卡路瑪也意外死亡。在這一過程中，幾乎每個人都留下了綽號為“傀儡師”的黑客即將到來的訊息。近兩年不斷壯大的公安九課受命調(diào)查此事，經(jīng)過戶草和巴特的層層追查，發(fā)現(xiàn)草薙素子也涉足其中。而隨著調(diào)查的深入，近年多起誘拐案件、逐漸凸現(xiàn)的貴腐老人現(xiàn)象甚至日本一些重要部門也都與傀儡師的案件有關(guān)。揭去重重迷霧，駭然的真相慢慢浮出水面…… 本片根據(jù)士郎正宗的同名原著改編，為舊版重制的3D版。